我國物流發展迅猛，所以往往一個階段的許多問題沒有得到解決就邁入了下一個階段，盡管出現了很多專業化程度不錯的物流企業，但是就效率、安全和標準化還需要長期完善。

物流基礎設施沒有形成體系

由于互聯網的普及，信息化對現代物流非常重要，企業計算機的擁有量也成為考核企業專業化程度的一項指標。如果單看擁有量，我國物流企業是95.9%，比例算是相當不錯，但真正運用計算機實現信息化的企業只有68.6%。只把計算機用于內部辦公的企業比例很大，甚至有些企業的計算機只能說是替代了打字機。在聯網的企業中，聯網計算機占企業計算機總數的比重平均值是76.7%。從聯網企業的比例和聯網計算機的比例來看，距離現代物流信息交換的要求還有相當的差距，表明我國相當數量的物流企業的信息化水平還處于低水平。

目前，能夠有效連接不同運輸方式的大型綜合貨運樞紐、服務于區域或城市的物流基地、物流中心等現代化物流設施還比較缺乏，嚴重影響著物流集散和運輸效率的提高。

倉儲基礎設施在數量上有一定規模，但其質量和功能明顯滯后。據1997年的數據顯示，全國的國有倉庫中，20世紀60年代前建的占37%、70年代的占28%、80年代的占34%。倉儲作業大部分還停留在人拉肩扛的原始水平上，一些起重裝卸設備早已超期服役，基礎設施普遍面臨陳舊老化、設備管理技術落后等問題，造成了單位勞動生產率過低。

物流企業競爭實力不足

一般來說，企業規模越小，運營成本往往越高，進而影響企業的經濟效益及長遠發展。隨著經濟全球化的不斷發展，大型的跨國公司成為大多數生產經營企業發展的方向。生產經營的國際化要求物流代理商擁有全球化的運作網絡為其提供物流支持。然而，目前我國從事物流服務的企業，包括傳統的運輸和儲運等流通企業和新型的專業化物流企業，還有一些本是農民倉庫、部隊倉庫和停產廠房轉營倉庫，以及個體、私營車隊，只是掛上“物流”的名稱，其規模和實力較小，網絡化的經營組織尚未形成。真正擁有可以信任的品牌、龐大的物流網絡、先進的管理體制、高素質的人才隊伍和豐富的運作經驗的物流龍頭企業還是鳳毛麟角。

企業提供的服務水平低

物流服務質量高低主要從商品物流時間、物流費用和物流效率三個方面來衡量。有關資料顯示，工業生產中物流所占用時間幾乎為整個生產過程的90%。目前，我國商品周轉率只有發達國家的30%，每平方米庫存的商品量只及發達國家的25%，配送差錯率為發達國家的3倍。我國一般工業品的流通費用占商品價格的5%，而新鮮水果、易變質食品和某些化工產品的流通費用有時達到商品售價的7%以上。如果從物流總體費用考慮，物流費用占商品總成本的比重，從賬面反映已超過40%。

目前物流普及程度不高，缺乏有效的以批量小、品種多、檔次高、緊急性強為特色的物流后勤支持，許多生產企業都不會雇傭第三方物流來解決運輸問題，而是自己解決，效率低，成本高，達不成雙贏的局面。

物流同時也是操作性很強的行業，要求人員有專業的知識，但在目前大多數人（包括企業老板）眼中，物流還是個門檻低的行業，招進的人員專業素質低，阻礙了企業乃至整個物流業的發展。